方慧生，1989、1992年于中国人民解放军第二军医大学分别获学士、硕士，1995年于中国药科大学获博士学位。2000年至2002年在瑞典斯得哥尔摩大学斯得哥尔生物信息学中心从事博士后研究。尔后分别为上海生物信息技术研究中心和上海药物研究所药物发现与设计中心客座研究员。2005年至今为中国药科大学教授。1996年获国家技术发明三奖(第二作者)，2002年12月在美国召开的CASP5会议上，在导师Arne Elofsson指导下建立的Pcons2，及与其他人合作的Pmodeller被评为最佳预测方法之一。 并在大会上作介绍(两个专家预测方法之一)
讲授课程(学生层次)
生物信息学(本科生)、药物生物信息学(硕士生)，后基因组信息学与药学研究(博士生)、生物信息学软件操作(博士生)
研究方向
1. 高质量远距离同源蛋白序列比较研究
2. 基于蛋白质二级结构预测的高质量蛋白质预测模型研究
3. 基于多重序列比对的高质量蛋白质预测模型识别研究
4. 蛋白质结构柔性研究
5. 基于正则分析的蛋白质运动研究
6. 蛋白质-DNA连接研究
7. 蛋白质代谢网络研究
已发表文章：
1. Li J and Fang HS Substitution Transformation of Score Matrix for Improving Alignment Quality of Local Sequence of Distantly Related Proteins, Current Bioinformatics,2012,7,35-42
2. Wallner, B., Fang, H., Ohlson, T., Frey-Skott, J. and Elofsson, A. (2004) Using evolutionary information for the query and target improves fold recognition. Proteins 54 (2) : 342-350. Cited 34 times , Impact Factor: 3.354
3. Wallner,B, Fang HS and Elofsson A, Automatic Consensus-Based Fold Recognition Using Pcons,ProQ, and Pmodeller, PROTEINS,2003, 53:534–541 (2003) Cited 76 times , Impact Factor: 3.354
4. Fang, H., Wallner, B. Lundström, J., von Wowern, C. and Elofsson, A. (2001) Improved fold recognition by using the Pcons consensus approach Chapter in “Protein structure prediction:Bioinformatic approach” IUL biotechnology Series, La Jolla, 1: 397-41. Cited 3 times , Impact Factor: 2.269
5 方慧生等。遗忘因子法在多组分体系分析中的应用，高等学校化学学报, 1994,15:518
6 方慧生等。遗忘因子法与其它计算方法在分光光度法中的应用研究，分析化学,1994,22:285
7 方慧生等。稳健Madaline网络算法及其在复方制剂分析中的应用，分析化学,1999,27:266
8 方慧生等。Madaline网络分离重叠光谱峰及其在多组分同时分析中的应用 分析化学，1999,27:14
9 方慧生等。Madaline网络分离重叠光谱峰在来色体系分析中的的应用研究 分析化学，1999,27:875
10 方慧生等。序列搜索算法在蛋白质及多肽质解谱解析中的应用，生物化学与生物物理学进展,1995,22:361
11方慧生等。多组分同时分析中单个组分的误差传递原理,中国药科大学学报 1997,29:362
12方慧生等。分支定界法在计算机辅助质谱解析蛋白质序列分析中的应用，中国药科大学学报，1994,25:177
13方慧生等。质谱在蛋白质及多肽氨基酸序列分析中的应用，药学进展， 1993,17:196
14方慧生等。改进Madaline学习算法预测蛋白质二级结构，中国药科大学学报，1996,27:366
15方慧生等。人工神经网络在蛋白质二级结构预测中的应用，药学进展， 1996,20:7
16方慧生等。褶合光谱比值法在未知背景干扰样品分析中的应用，药物学研究与展望，1999,194
17方慧生等。基于PCR的Madaline网络算法及其在分解严重重叠光谱峰中的应用，计算机与应用化学，2000,17:96
18方慧生等。光谱比值技术在未知背景干扰样品分析中的应用,计算机与应用化学，2000,17:121
19方慧生等。基于Kalman滤波法的Madaline网络算法及其在部分未知背景干扰样品分析中的应用,计算机与应用化学, 2000,17:122
20方慧生等。EME联立方程组法在多组分分析中的应用，光谱仪器与分析，1997,19
21方慧生等。复杂混合物不分离分析分析研究灰色体系的光谱学方法，光谱仪器与分析
22 方慧生等。蛋白质天然构象预测研究进展，中国药科大学学，2005，36:195
23 方慧生等。基于折叠识别法的蛋白质天然构象的一致性预测法Pcons2与聚类分析的理论探讨，中国药科大学学报，2006,37:77
24 徐建平，方慧生，相秉仁。一种快速比较蛋白质结构预测模型相似性的方法，中国药科大学学报，2006，37:281待刊
25 徐建平，方慧生，相秉仁。基于常用得分矩阵的神经网络法预测蛋白质二级结构性能的考察，中国药科大学学报，2006，37：470
26 彭敏,方慧生。酶功能分类与序列相似性研究进展。国外医学药学分册,2006, 33(6): 452-455
